После того, как родители Такэру Яги умерли, мальчика взял к себе на воспитание глава семьи Тома — Рокуносукэ Тома. Теперь Такэру всегда окружают люди, среди которых его лучший друг и заклятый соперник из клуба кэндо — Такэси Ямато, его сводные сёстры Котоно и Асука Сиратори, а также его подруга детства Сэри Осу.

Жизнь парня была чудесной, пока в один прекрасный день мощное землетрясение не разрушило его школу. Очнувшись, Такэру лицезрит жуткую картину: его любимая школа разрушена так, как будто это столетние руины. Кроме того, Такэру обнаруживает, что все учителя и ученики бесследно исчезли. Вскоре он натыкается на Сэри и Асуку, и троица спешно покидает злосчастное место. Побродив по городу, ребята понимают, что исчезло всё его население.