История происходит в будущем после того, как девяносто процентов человечества было уничтожено из-за вторжения инопланетных захватчиков. Оставшиеся в живых живут в приютах, где их жизнь контролируется, а воспоминания о вторжении стёрты.
Трое подростков из приюта были выбраны для пилотирования трёх робо-машин, которые объединяются, чтобы сформировать робота Мусаси, сделанного из материала, названного сплавом «мегатрония». Однако, каждый из пилотов робо-машины столкнётся с невообразимой угрозой.