Однажды человечество оказалось на грани уничтожения по вине зловещего учёного Доктора Хелла и его подпольной империи. Кодзи Кабуто со своим роботом Мазингер Зет и друзьями по лаборатории фотонной энергии вознамерился положить конец дьявольским намерениям Доктора Хелла и вернуть миру спокойствие.
С тех пор прошло десять лет. Кодзи пошёл по стопам отца и деда и теперь познаёт путь учёного. Вскоре он сталкивается с поистине загадочной формой жизни, захороненной глубоко под горой Фудзи.
Новые события, новые угрозы и уже новая судьба ждёт человечество. И Кодзи, бывалый герой, вынужден принять решение, определяющее исход будущего. Бог или Дьявол?.. В очередной раз будущее доверено Мазингеру Зет.