Пока Избранные дети и их디지몬-партнёры счастливо живут в мире людей, Таити Ягами и Ямато Исида вместе с друзьями посвящают себя сохранению этого нелегко доставшегося мира. Хотя их объединяет это врождённое чувство долга, каждый уже начал делать первые шаги к будущему, которое выходит за рамки роли Избранного ребёнка.

Однако это новое путешествие прерывает появление Мэноа Беллуччи — американского профессора, специализирующегося на исследовании Дигимонов. Она приносит тревожные вести: по всему миру находят Избранных детей в состоянии комы, а их партнёры-Дигимоны исчезли без следа. Расследование Мэноа указывает на то, что за этим пугающим явлением стоит новый вид Дигимонов — Эосмон, скрывающийся в глубинах интернета.

Чтобы выполнить эту миссию, команде придётся преодолеть растущую пропасть между ними и в последний раз объединить свои силы.