«MS IGLOO 2» вновь возвращается к событиям первого «MS IGLOO» и рассказывает историю уже со стороны солдат Федерации, вынужденных сражаться против чудовищных Заку. В каждой серии — своя история отдельного солдата Федерации, над которым словно навис проклятием сам Бог Смерти, спустившийся на землю вместе с Заку. Перед зрителем предстаёт отчаянная борьба против мобильных доспехов, которую приходится вести лишь обычным оружием — танками и ракетами. Каждый солдат, движимый жаждой мести и преследуемый тенью Бога Смерти, бросает вызов, казалось бы, непреодолимой мощи Заку.