Освободившись от своих обязанностей с 501-ым секретным отделом,
Мотоко Кусанаги теперь должна выполнять приказы
Дайсукэ Арамаки. Кто-то взломал искусственный интеллект
Логикомы и
Бато начинает собирать команду. Он заручается поддержкой бывшего армейского офицера разведки
Исикавы и специалиста по взрывчатке и подрывному делу
Бомы.
Кусанаги также стремится привлечь к этому расследованию снайпера
Сайто и тайного агента
Падзу.
Девятый отдел разворачивает очередную операцию.