Избранные дети наконец воссоединились со своими digimon-партнёрами, однако из-за цифрового сброса те начисто забыли их. Пока остальные пытаются наладить контакт со своими цифровыми монстрами, Сора Такэноути сталкивается с явным сопротивлением: Пиёмон упрямо отказывается с ней разговаривать. Внезапно на группу нападает враждебный цифровой монстр, и взрыв разбрасывает ребят вместе с их партнёрами по всему Цифровому миру.

Тем временем в мире людей Дайго Нисидзима из Государственного административного агентства получает тревожное сообщение: за неким существом под кодовым именем «Либра» началась охота новой силы. Дайго уверен, что «Либра» — это просто ещё одно имя Мэйкумон. По неизвестной причине Мэйкумон не потеряла память и по-прежнему помнит свою партнёршу — Мэйко Мотидзуки, которая в одиночку отправилась в Цифровой мир на её поиски. Чтобы понять, какие ещё силы стоят за происходящими событиями, Избранным детям предстоит преодолеть все препятствия воссозданного Цифрового мира и найти дорогу домой.